二套房46万需缴纳的税费具体如下：
1、契税：90平米以下契税1%，90-140平米契税1.5%，140平米以上契税3%，那么，有的地方是按照144平米算。这是购买首套房的契税税率，二套房契税一律3%。例如：商业住宅，是不限购的住房，规定此类住房征收全额契税3%没有优惠。普通商品房住房，规定是首套买入前提90平以下契税1%，90平以上1.5%。如二套买入90平以下契税1.5%，90平以上契税2%，三套以及三套以上则是契税3%；
2、个人所得税：购买二套房的个人所得税为1％。如果个人转让自用5年以上而且是家庭的唯一住宅的免征个人所得税。但是，如果出售自有住房一年内再次买房的就不免征个人所得税；
3、营业税：如果个人将购买不足2年的住房对外销售的，全额征收营业税。如果个人将购买2年以上的住房对外销售的，免征营业税。
《中华人民共和国个人所得税法》第三条
个人所得税的税率：
（一）综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率；
（二）经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率；
（三）利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。
