二审发现结婚证丢了并不影响法院最终的判决结果。首先，结婚证仅仅是证明男女双方何时建立合法夫妻关系的证据。既然离婚诉讼案件已经进入二审程序，说明一审审理过程中已经出示过证据原件，即结婚证原件有可能暂时由法院保管，所以第一个途径是向一审法院法官和书记员进行查询。其次，若一审法院找不到结婚证原件，那么还有一种办法是带上身份证原件前往原来办理结婚登记的民政部门查询自己的婚姻登记档案，加盖有婚姻登记档案保管部门印章的婚姻登记档案复印件亦可证明婚姻关系存在，与结婚证具有同等法律效力。
我国实行两审终审制，针对一审判决不服的，任何一方均有权在法定期限内提出上诉。而无论是一审还是二审，法院判决是否准予离婚的关键因素是夫妻双方是否确实属于感情已经完全破裂的情形。所以，结婚证丢失并不影响法院的判决结果。
《中华人民共和国婚姻法》第三十二条离婚诉讼
男女一方要求离婚的，可由有关部门进行调解或直接向人民法院提出离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。有下列情形之一，调解无效的，应准予离婚：（一）重婚或有配偶者与他人同居的；
（二）实施家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员的；（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改的；
（四）因感情不和分居满二年的；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。一方被宣告失踪，另一方提出离婚诉讼的，应准予离婚。
