发生货物运输合同纠纷，首先要确定当事人是否具有诉讼主体资格。然后是对承运人、托运人、收货人的损害赔偿责任进行审查。
第一、承运人的损害赔偿责任
1、归责原则：以货物在运输过程中发生毁损、灭失为要件，采取严格责任原则。
2、举证责任：托运人对其与承运人存在运输合同关系，以及货物在运输过程中发生毁损、灭失承担举证责任;承运人对免责事由承担举证责任。
第二、托运人的违约责任。
1、未按约定的时间和要求向承运人交付货物或者有关文件的，应承担继续履行、支付违约金、赔偿损失等民事责任;
2、违反运输危险品的规定，应当采取补救措施、支付违约金、赔偿实际损失;
3、未妥善包装货物致使他人财产、人身损害，应当承担损害赔偿责任;
4、收货人不明或因收货人拒绝受领货物的，托运人应当承担责任。
第三、收货人责任。
1、未付清应由其支付的运费以及其他运输、保管费用的，应支付该费用并缴纳滞纳金;
2、逾期提取货物的，应当支付保管费;受领货物的过程中导致运输工具、设备或者第三人的货物发生毁损、灭失的，应当赔偿承运人或第三人的损失。
《中华人民共和国合同法》第三百一十一条
【承运人的赔偿责任】承运人对运输过程中货物的毁损、灭失承担损害赔偿责任，但承运人证明货物的毁损、灭失是因不可抗力、货物本身的自然性质或者合理损耗以及托运人、收货人的过错造成的，不承担损害赔偿责任。
《中华人民共和国合同法》第三百一十二条
【确定货损额的方法】货物的毁损、灭失的赔偿额，当事人有约定的，按照其约定；没有约定或者约定不明确，依照本法第六十一条的规定仍不能确定的，按照交付或者应当交付时货物到达地的市场价格计算。法律、行政法规对赔偿额的计算方法和赔偿限额另有规定的，依照其规定。
