保健品注册专利的流程是，向专利管理部门提交请求书，说明书和权利要求书等材料，初步审查，实际审查，发放专利证书并予以公告。专利申请被驳回时可以提出复审。
保健品注册专利的方式：首先，当事人提交请求书、说明书及其摘要和权利要求书等文件。然后，专利行政部门进行十八个月的初步审查，并自申请日起三年内，进行实时审查。最后，审查通过的，发给发明专利证书，同时予以登记和公告。
专利申请被驳回时可以提出复审。
根据《中华人民共和国专利法》规定，国务院专利行政部门设立专利复审委员会。专利申请人对国务院专利行政部门驳回申请的决定不服的，可以自收到通知之日起三个月内，向专利复审委员会请求复审。专利复审委员会复审后，作出决定，并通知专利申请人。专利申请人对专利复审委员会的复审决定不服的，可以自收到通知之日起三个月内向人民法院起诉。
找法网提醒您，专利申请复审费用要分情况。发明专利复审费用为1000元，实用新型专利和外观设计专利复审的费用为300元。但有几点需要注意：
1.复审请求人在收到驳回决定之日起三个月内提出了复审请求，若在此期限内未缴纳或者未缴足复审费的，则他的复审请求视为未提出。
2.在专利复审委员会作出视为未提出决定后复审请求人提出恢复权利请求的，如果恢复权利请求符合《专利法实施细则》有关恢复权利的规定，则允许恢复，且复审请求应当予以受理;不符合上述规定的，不予恢复。
3.在收到驳回决定之日起三个月后才缴足复审费、且在作出视为未提出决定前提出恢复权利请求的，可对上述两请求合并处理;该恢复权利请求符合《专利法实施细则》有关恢复权利的规定的，复审请求应当予以受理;不符合该有关规定的，复审请求视为未提出。
