子女抚养权管辖法院是一般是被告所在地法院。被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。离婚时处理子女抚养权问题的方式是根据子女年龄大小进行确定，一般不满两周岁的孩子由女方进行抚养。
子女抚养权的管辖法院应该选择被告人所在地的法院，根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，一般的民事纠纷，被告人所在地的法院都有管辖权，不过，子女抚养问题最好在解除婚姻关系的同时就处理好，离婚后有特殊情况的，也能申请变更抚养权。
《中华人民共和国民事诉讼法》第二十一条，对公民提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖;被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。对法人或者其他组织提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖。同一诉讼的几个被告住所地、经常居住地在两个以上人民法院辖区的，各该人民法院都有管辖权。
找法网提醒您，离婚时处理子女抚养权问题的方式：不满两周岁的子女，一般由母亲直接抚养。已满两周岁的，父母协议不成的，由人民法院根据双方情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
子女抚养权变更的条件有：
1.与子女共同生活的一方因患严重疾病或因伤残无力继续抚养子女的；
2.与子女共同生活的一方不尽抚养义务或有虐待子女行为，或其与子女共同生活对子女身心健康确有不利影响的；
3.8周岁以上未成年子女，愿随另一方生活，该方又有抚养能力的；
4.有其他正当理由需要变更的。
5.根据以上规定，只要具有上述任意一个条件，即可向人民法院申请变更抚养权。
离婚后，孩子由谁抚育，应从有利于孩子健康成长的角度考虑，在这个前提下，夫妻离婚时可以协商确定，协商不成，可由人民法院判决。
