民事诉讼指定管辖的程序是人民法院对于不能行使管辖权的特殊案件，经过上级人民法院的指定后，对该案件进行管辖。指定管辖是通过上级人民法院的指定使没有管辖权的人民法院具有管辖权，人民法院受理案件后当事人可以在法定期间内提出管辖异议。
有管辖权的人民法院由于特殊原因，不能行使管辖权的，由上级人民法院指定管辖。人民法院之间因管辖权发生争议，由争议双方协商解决；协商解决不了的，报请它们的共同上级人民法院指定管辖《民诉法》第37条有管辖权的人民法院由于特殊原因，不能行使管辖权的，由上级人民法院指定管辖。人民法院之间因管辖权发生争议，由争议双方协商解决;协商解决不了的，报请它们的共同上级人民法院指定管辖。人民法院受理案件后，当事人对管辖权有异议的，应当在提交答辩状期间提出。人民法院对当事人提出的异议，应当审查。异议成立的，裁定将案件移送有管辖权的人民法院;异议不成立的，裁定驳回。
民事诉讼管辖又称“民事审判管辖”。法院之间受理第一审民事案件的分工和权限。基于管辖权而产生，是对民事案件审判权的一种“恒定”，法院对于没有管辖权的民事案件无权审理。各国法律规定管辖不尽一致，一般按三种不同的标准划分：以法律规定和法院裁定为标准，分为法定管辖和裁定管辖，法定管辖又可分为级别管辖和地域管辖；裁定管辖又分为移送管辖和指定管辖。以强制规定和任意规定为标淮，分为专属管辖和协议管辖。以诉讼关系为标准，分为共同管辖和合并管辖。管辖一经确定，法院取得对案件的审判权，当事人不能去其他法院起诉或应诉
接受移送案件的人民法院认为移送的案件按法律规定不属于本院管辖的，依法报请上级法院指定管辖。
有管辖权的人民法院因特殊原因不能行使管辖权的，由上级法院指定管辖。特殊原因包括法律上的原因(如审判人员全部被申请回避)和事实上的原因(如自然灾害等)。
人民法院之间因管辖权发生争议，协商不成，报请他们的共同上级法院指定管辖。如双方为同属一个地、市辖区的基层人民法院，由该地、市的中级法院及时指定管辖;同属一个省、自治区、直辖市的两个人民法院，由该省、自治区、直辖市的高级法院及时指定管辖;如双方为跨省、自治区、直辖市的人民法院，高级人民法院协商不成的，由最高人民法院及时指定管辖。报请上级人民法院指定管辖应逐级进行。
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