年休假不会扣年终奖的，因为年休假是职工依法享有的福利，在休年假期间职工是享受与正常工作期间相同的工资收入的。年休假的计算方法是以职工的工作年限为依据，职工累计工作已满1年不满10年的，年休假5天。
休年假不扣年终奖。年假是带薪年休假，工资应当正常发放。找法网提醒，带薪年休假，顾名思义，在带薪年休假期间，职工享受与正常工作期间相同的工资收入。如果单位扣奖金是违法的。
法律依据：《中华人民共和国劳动法》 第四十五条 国家实行带薪年休假制度。劳动者连续工作一年以上的，享受带薪年休假。具体办法由国务院规定。
年休假计算方法以工作年限为准，《职工带薪年休假条例》第三条：职工累计工作已满1年不满10年的，年休假5天； 已满10年不满20年的，年休假10天；已满20年的，年休假15天。 国家法定休假日、休息日不计入年休假的假期。
年休假的法律规定有：
《职工带薪年休假条例》第二条规定： 机关、团体、企业、事业单位、民办非企业单位、有雇工的个体工商户等单位的职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假（以下简称年休假）。单位应当保证职工享受年休假。职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。
第三条规定： 职工累计工作已满1年不满10年的，年休假5天;已满10年不满20年的，年休假10天;已满20年的，年休假15天。国家法定休假日、休息日不计入年休假的假期。第五条规定： 单位根据生产、工作的具体情况，并考虑职工本人意愿，统筹安排职工年休假。年休假在1个年度内可以集中安排，也可以分段安排，一般不跨年度安排。单位因生产、工作特点确有必要跨年度安排职工年休假的，可以跨1个年度安排。单位确因工作需要不能安排职工休年休假的，经职工本人同意，可以不安排职工休年休假。对职工应休未休的年休假天数，单位应当按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬。
