应该认定夫妻分居债务的方法有：
1.因共同生产、生活形成的债权、债务为共同的债权、债务。
在同居期间，借款人只要是为了同居双方的共同利益，目的是为了同居生活的需要并用于同居生活、生产经营，不管是以双方名义还是以一方名义与他人建立的债务关系，均应视为同居期间的共同之债。
2.男女一方在同居前所负的债务，同居后与共同生活无关所负的债务可确认为个人债务。在同居关系期间，一方以个人名义对外所负债务，除非为同居双方共同生产、生活需要而形成，否则推定为个人债务。找法网提醒您，因抚养共同的子女所形成的债务为共同债务，因抚养各自的子女及赡养形成的债务为义务人个人债务。
夫妻债务可以协商各自承担。根据民法典的规定，夫妻双方可以约定，婚姻关系存续期间取得的财产和婚前财产归个人所有，共同或者部分单独。夫妻对婚姻关系期间取得的财产和婚前财产的约定，对夫妻双方都具有约束力。夫妻约定婚姻期间取得的财产属于对方的，第三人知道该约定的，以夫妻所有的财产来清偿夫妻债务。
分居并不会自动离婚。夫妻分居有两种类型：第一种是因客观原因造成的，如夫妻俩分别在两个城市工作，没有同居的条件，这种夫妻分居的情形，不是因感情不和而分居，即是夫妻分居时间满两年也不符合“因感情不和分居”的法定提出离婚的理由。第二种是主观原因造成的，如婚姻基础不牢固，婚后没有培养起夫妻感情而分居满两年的，符合“因感情不和分居”的法定离婚的理由。分居时间应连续计算。因关于分居的举证比较困难，一般要双方共同认可。分居两年并不能自动离婚，它只是判断离婚的一个因素，离婚只有通过民政部门登记或者法院诉讼离婚才可以解除婚姻关系。
