协议离婚双方三十日时间后能离婚，《中华人民共和国民法典》第一千零七十七条，自婚姻登记机关收到离婚登记申请之日起三十日内，任何一方不愿意离婚的，可以向婚姻登记机关撤回离婚登记申请。前款规定期限届满后三十日内，双方应当亲自到婚姻登记机关申请发给离婚证；未申请的，视为撤回离婚登记申请。
一方不愿意协议离婚的，可以起诉。夫妻一方向对方提出离婚请求后，对方不愿意离婚的，要求离婚的一方可以向人民法院提起离婚诉讼，人民法院对离婚案件审理后，发现夫妻之间的感情已经完全破裂的，在调解无效后，应当判决离婚。因此一方提出离婚请求后，另一方不愿意离婚的，可以起诉离婚，只要能证明感情已经完全破裂，人民法院会判决离婚。
协议离婚程序如下：
1.申请。夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，持有效证件和证明材料共同到具有管辖权的婚姻登记机关提出申请，找法网提醒您，在婚姻登记机关现场填写《离婚登记申请书》。
2.受理。婚姻登记机关对当事人提交的证件和证明材料进行初审。
3.冷静期。自离婚冷静期届满后三十日内，双方未共同到婚姻登记机关申请发给离婚证的，视为撤回离婚登记申请。
4.审查。婚姻登记机关依据相关规定对当事人的真实意愿、证件和证明材料、离婚协议书等进行审查。对不符合离婚登记条件的不予办理。当事人要求出具《不予办理离婚登记告知书》的，应当出具。
5.登记（发证）。婚姻登记机关按照相关法律法规的规定予以登记，发给离婚证。
