医疗损害赔偿与医疗事故赔偿在法律适用、医疗鉴定、赔偿项目、计算方法和赔偿数额却有很大不同。
第一，在法律适用方面。审理一般医疗损害赔偿案件要适用《民法典》、《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》和《最高人民法院关于审理人身损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》的有关规定；而审理医疗事故损害赔偿案件则要适用《医疗事故处理条例》及配套的的法规文件。
第二，在医疗鉴定方面。医疗事故损害赔偿案件一律需要医疗事故技术鉴定，而一般医疗损害赔偿案件则可能需要司法鉴定。《高法意见》明确规定：“人民法院需要委托进行医疗事故技术鉴定的，应当委托医学会组织鉴定;需要委托进行其他医疗鉴定的，可以委托具有相应资质的司法鉴定机构组织鉴定。”“一方当事人申请进行有关医疗过错的司法鉴定，而另一方当事人申请进行医疗事故技术鉴定的，人民法院应当委托进行医疗事故技术鉴定并要求提出该申请一方预交鉴定费。”
第三，在损害赔偿方面。一般医疗损害赔偿和医疗事故损害赔偿的最显著区别就表现在赔偿项目、赔偿系数和赔偿数额上的不同。
1、赔偿项目。医疗事故损害赔偿包括11项，而一般医疗损害赔偿包括12项，二者除了在项目计算上存在差异外，后者较前者还增加一项“死亡赔偿金”。
2、赔偿系数。医疗事故损害赔偿要考虑责任程度、原发疾病、事故等级等因素，而一般医疗损害赔偿则要考虑过失参与度、责任程度、损害结果、因果关系、收入差异等因素。虽然根据民法原则上述所有因素都是广义人身损害赔偿纠纷中需要考虑的法律情节，但从我国现行法律规定和司法实践看，二者确实存在明显区别。为使法律法规渐进统一，《高法意见》最新规定“确定医疗损害赔偿数额，应当综合考虑医疗过失行为在医疗损害后果中的责任程度、医疗损害后果与患者原有疾病状况之间的关系及医疗风险状况等因素。”
3、赔偿数额。对此《高法意见》规定：“确定医疗事故损害赔偿标准，应当参照《医疗事故处理条例》第49条至第52条的规定;如参照《医疗事故处理条例》处理将使患者所受损失无法得到基本补偿的，可以适用《民法典》及相关司法解释的规定适当提高赔偿数额。”“确定一般医疗损害赔偿标准，应当适用《民法典》及相关司法解释的规定。”
1、医疗纠纷赔偿的行为人必须是医疗机构或者医务人员
如果非医疗机构或非医务人员对人损害的，虽然可能构成损害赔偿，但并非医疗损害赔偿。如非法行医给人造成损害的，只能按人身损害赔偿处理。医疗机构承担责任的，除医疗机构所属的医务人员在医疗过程中给患者造成损害的以外，还包括医疗机构聘请外单位的医师、专家、临时坐诊的医务人员或进修、实习等医务人员在医疗过程中给患者造成损害的，该医疗机构不得以医务人员不是本单位人员推脱责任。医疗机构因医疗设备故障等原因给患者造成损害的，医疗机构不能免责。
2、医疗机构或医务人员必须有过失
主要是指医院监督、管理注意的义务和违反，医务人员注意的义务是应该明确作为医生对患者的症状应当予以注意。依现代的医学知识，在注意考虑药物效果及副作用等前提下确定治疗方法，在安全的注意下实行治疗阶段和医务护理过程，同时注意给患者的提示、告知义务等所必须的医疗服务的职业道德规范。
医疗过失行为是违背了医疗水准和未尽到最高注意义务的医疗行为，具体应该分为两类：一种如错误诊断、开错药、不当手术等违背了医疗水准的过失行为；一种如对患者推诿拒治、贻误治疗时机，对患者报告不予理踩、不按护理规范、不按时观察患者、不尽告知义务等，给患者造成损害的过失行为。
3、不属于医疗事故医疗机构不承担赔偿责任
根据《医疗事故处理条例》第33条规定和第49条规定：不属于医疗事故的，医疗机构不承担赔偿责任。
1、完全责任：
指医疗事故损害后果完全由医疗过失行为造成。（赔偿全部损失的100%）
2、主要责任：
指医疗事故损害后果主要由医疗过失行为造成，其他因素起次要作用。（赔偿全部损失的60-90%）
3、次要责任：
指医疗事故损害后果主要由其他因素造成，医疗过失行为起次要作用。（赔偿全部损失的20-40%）
4、轻微责任：
指医疗事故损害后果绝大部分由其他因素造成，医疗过失行为起轻微作用。（赔偿全部损失不超过10%）
实践中还存在对等责任：即医、患双方各负担50%。
责任程度的不同，对于赔偿数额的影响较大，显不了过错程序与承担责任一致的原则，比原《医疗事故处理办法》确定的只要鉴定为事故不考虑责任程度一律承担100%赔偿的内容较为公正、合情合理。
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