分居后起诉离婚程序如下：
1、当事人携带民事起诉状、身份证等相关材料，到被告住所地或者经常居住地人民法院提起离婚诉讼；
2、符合立案条件后，法院受理；
3、法院开庭审理；
4、由法院进行调解；
5、法院作出准予离婚或不准予离婚的判决。
根据《民法典》第一千零七十九条第一、二款规定，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
《民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
