农民工工伤鉴定程序和其他职工工伤鉴定程序是一样的，应该这样：
1、申请工伤认定：发生工伤事故后，用人单位应该在30天内申请工伤认定，工伤职工也可以在工伤事故发生后1年内申请工伤认定。
2、提出劳动能力鉴定申请：职工发生工伤，经过治疗伤情相对稳定后，由工伤职工或者用人单位向劳动能力鉴定委员会提出劳动能力鉴定申请。
3、提交相关材料：填写劳动能力鉴定申请表，提交《工伤认定决定书》、诊断证明、检查检验报告等完整病历材料，工伤职工的居民身份证或者社会保障卡等。
4、劳动能力鉴定委员会审核：劳动能力鉴定委员会在60个工作日内作出劳动能力鉴定结论。伤情复杂、涉及医疗卫生专业较多的，可以延长30日。
申请工伤认定虽然不属于工伤鉴定程序，但属于工伤鉴定程序的前置程序。
《工伤保险条例》第十七条
职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。
用人单位未按前款规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其直系亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区劳动保障行政部门提出工伤认定申请。
按照本条第一款规定应当由省级社会保险行政部门进行工伤认定的事项，根据属地原则由用人单位所在地的设区的市级社会保险行政部门办理。
用人单位未在本条第一款规定的时限内提交工伤认定申请，在此期间发生符合本条例规定的工伤待遇等有关费用由该用人单位负担。
