一般来说，孩子三个月，在离婚时，是以由母亲直接抚养为原则的
需要注意的是：为了保护女性的权益，在女方分娩一年内，男方不得提出离婚，但是女方提出离婚的，不受限制
根据《民法典》第一千零八十二条规定，女方在怀孕期间、分娩后一年内或者终止妊娠后六个月内，男方不得提出离婚；但是，女方提出离婚或者人民法院认为确有必要受理男方离婚请求的除外
第一千零八十四条第三款规定，离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则
已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决
子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿
《中华人民共和国民法典》第一千零八十二条女方在怀孕期间、分娩后一年内或者终止妊娠后六个月内，男方不得提出离婚；但是，女方提出离婚或者人民法院认为确有必要受理男方离婚请求的除外
第一千零八十四条第三款离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则
已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决
子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿
