工厂超时加班投诉流程：
1、从劳动部门的官网投诉入口进行投诉；
2、直接拨打相关劳动部门的投诉电话，或者拨打市民热线进行投诉；
3、携带相关材料到用人单位主体管辖范围内的劳动部门窗口进行投诉，交由相关人员受理，并出具受理回执。
《劳动合同法》第三十一条规定，用人单位应当严格执行劳动定额标准，不得强迫或者变相强迫劳动者加班。用人单位安排加班的，应当按照国家有关规定向劳动者支付加班费。
《劳动法》第四十一条规定，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。
