机动车违章停车是会扣分的，而且根据违章情节的不同，扣分标准也有所不同，具体如下：
1、驾驶营运客车在高速公路车道内停车的，一次记12分；
2、驾驶营运客车以外的机动车在高速公路车道内停车的，一次记6分；
3、驾驶机动车行经交叉路口不按规定行车或者停车的，一次记2分；等等。法律依据：《道路
交通安全违法行为记分分值》 第一条 机动车驾驶人驾驶营运客车在高速公路车道内停车的，一次记12分。
（一）驾驶与准驾车型不符的机动车的；
（二）饮酒后驾驶机动车的；
（三）驾驶营运客车（不包括公共汽车）、校车载人超过核定人数20%以上的；
（四）造成
交通事故后逃逸，尚不构成犯罪的；
（五）上道路行驶的机动车未悬挂机动车号牌的，或者故意遮挡、污损、不按规定安装机动车号牌的；
（六）使用伪造、变造的机动车号牌、行驶证、驾驶证、校车标牌或者使用其他机动车号牌、行驶证的；
（七）驾驶机动车在高速公路上倒车、逆行、穿越中央分隔带掉头的；
（八）驾驶营运客车在高速公路车道内停车的；
（九）驾驶中型以上载客载货汽车、校车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速20%以上或者在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速50%以上，以及驾驶其他机动车行驶超过规定时速50%以上的；
（十）连续驾驶中型以上载客汽车、危险物品运输车辆超过4小时未停车休息或者停车休息时间少于20分钟的；
（十一）未取得校车驾驶资格驾驶校车的。
