一户两宅基地的确权方式如下：
1、农村部分村民虽然拥有多处宅基地，但是多余处的宅基地面积不大，农户所拥有的宅基地总面积不超过当地设定的宅基地标准，就属于合法宅基地，可以完成确权工作；
2、以前的房屋由子女来继承，这样的情况也导致部分家庭拥有一户多个宅子，这类情况法律上是认可的，可以进行相关的确权；
3、宅基地是村集体的财产，所有权是属于村集体的，而是农民个人，使用农民可以在本集体的范围内转让和买卖房屋财产，但是不可以向外售卖。
：《
中华人民共和国土地管理法》第六十二条法律依据：《中华人民共和国土地管理法》第六十二条
农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。
人均土地少、不能保障一户拥有一处宅基地的地区，县级人民政府在充分尊重农村村民意愿的基础上，可以采取措施，按照省、自治区、直辖市规定的标准保障农村村民实现户有所居。
农村村民建住宅，应当符合乡（镇）土地利用总体规划、村庄规划，不得占用永久基本农田，并尽量使用原有的宅基地和村内空闲地。编制乡（镇）土地利用总体规划、村庄规划应当统筹并合理安排宅基地用地，改善农村村民居住环境和条件。
农村村民住宅用地，由乡（镇）人民政府审核批准；其中，涉及占用农用地的，依照本法第四十四条的规定办理审批手续。
农村村民出卖、出租、赠与住宅后，再申请宅基地的，不予批准。
国家允许进城落户的农村村民依法自愿有偿退出宅基地，鼓励农村集体经济组织及其成员盘活利用闲置宅基地和闲置住宅。
国务院农业农村主管部门负责全国农村宅基地改革和管理有关工作。
集体土地住宅确权三要素是什么
1、申请房屋确权人必须是集体成员且必须要是房屋的所有权人；
2、申请房屋确权人有正规合法的身份证、户口本等，黑户不行；
3、房屋有用地有规划批准文件、房屋竣工验收合格证明或房屋赠与、继承、转移、担保合同书或批准文件等。
