1、适用范围不同，诉讼时效3年是发生在从权利人知道或者应当知道权利受到损害与义务人适用；而20年是从权利发生损害后就开始适用；
2、意义不同，诉讼时效3年指的是普通的诉讼时效，而20年是法律规定最长权利保护期间，超过二十年其权利不受保护。
《民法典》第一百八十八条：向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
普通诉讼时效届满并不消灭实体权利。
这就是说，普通诉讼时效届满，导致权利人的胜诉权消失，人民法院不再予以强制保护。但是，权利人基于民事法律关系所享有的民事权利（实体权利）仍然存在，所以，义务人在普通诉讼时效届满之后自愿向权利人履行义务的，权利人仍然有权接受。不受普通诉讼时效限制。而且基于当事人实体权利义务的存在，义务人在自愿履行义务后，又以超过普通诉讼时效为由反悔的，人民法院也不予以支持。但是，如果有证据证明实体权利本身已因其他原因而消灭的，则履行义务的义务人可以不当得利为由要求返还。
除斥期间是指法律规定某种民事实体权利存在的期间。权利人在此期间内不行使相应的民事权利，则在该法定期间届满时导致该民事权利的消灭。
普通诉讼时效与除斥期间的区别表现在诸多方面：
1、法律后果不同
虽然普通诉讼时效和除斥期间的法律后果都表现为某种权利的消灭，但是，普通诉讼时效所消灭的是权利人享有的胜诉权，而除斥期间则消灭的是权利人享有的实体民事权利本身，如追认权、撤销权、解除权等。
2、期间不同
虽然普通诉讼时效和除斥期间都以一定事实状态存续一定时间为内容。但是，普通诉讼时效是可变期间，适用中止、中断或延长的规定，而除斥期间则一般是不变期间。不因任何事由而中止、中断或者延长。
3、适用依据不同
普通诉讼时效规定的是权利受害人请求法律保护的期限，仅适用于权利受到侵害的权利人不行使请求权的情况，而除斥期间规定的是权利人行使某项权利的期限，以权利人不行使该实体民事权利作为适用依据。
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