意思自治原则所内含的民法价值主要是自由，其强调民事主体的自主选择、自主行为与自主责任，其在本质上排斥他人对自己事务的干涉。公平原则所内含的民法价值主要是公平、正义。一般情况下自由是公平正义的前提和基础，同时也是公平原则的基本价值要求。但在一些特殊情况下的自由处分可能会有害于他人利益和违反社会公平正义。此时的公平则意味着对自由的限制和干涉。
意思自治原则是指民事主体可依自己的自由意志从事民事活动。意思自治包含自主参与、自主选择、自己责任等基本内容。
民法的基本原则，是指民事立法、民事司法和民事活动的指导思想和价值准则。
民事意思自治原则是民法中的基本原则，有了意思自治原则，当事人就可以在不违反相关法规的情形下，按照自己的想法来选择法律原则。
赋予民事主体在法律规定的范围内享有广泛的自由。当事人有权依法从事某种民事活动和不从事某种民事活动。当事人有权选择其行为的内容和相对人。民事主体有权选择其行为的方式、有权选择补救方式。
允许当事人通过法律行为调整他们之间的关系。允许民事主体从事民事法律关系时，通过自己的意志产生、变更和消灭民事法律关系。
确立了先下机关干预与民事主体的行为自由的合理界限。根据意思自治原则，法无明文禁止即为自由。也就是说只要不违反法律、法规的强制性规定和公序良俗，国家就不得对其进行干预。行政机关也不得限制和干预民事主体依据民事基本法律享有的财产自由和人身自由。
任何一种自由本身都包含着某种限制，没有限制便无所谓自由。没有限制，“自由”不过是一种任性，或者是一种主观愿望，在现实生活中是不存在的。早在提出“意思自治”学说之时，杜摩林就指出，那些具有强制性的习惯，是不能以当事人的意思而排除其适用的。法律上所讲的自由也必须是为国家法律所认可所保护的自由。个人自由必须制约于“必须不使自己有碍于他人”这样一个限度内。从法律的角度讲，各种自由权利都必须有一个明确的边际，在这个边际所指明的范围之内，权力的主体可以从事他想干的一切事情，别人的干涉是违法的。如果超出这个范围，自由就失去了权力的性质，他的行为就是违法的。因为这个时候他必然会损害其他人的合法权益。自由是一种权利，而限制则是一种责任。限制是对自由的制约，又是对自由的保障，他要求个人在行使自由权利是要对他人负责，对社会负责。法律在自由却认为权利的同时，也就确定了各种自由权力的范围，使之有可能在自由的法律通则之下互相协调。 对意思自治进行限制的另一个原因是任何社会主体的行为都必须受制于国家权力。国家权力存在的目的首先是为了保障个人的自由，但是为了实现保障个人自由的目的，国家权力有时候必须对当事人的行为进行适当限制。
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