电商校企合作协议书签署后并不是一定会生效，若是存在以下情形，协议无效：
1.与无民事行为能力人签署的合同无效
《民法典》第一百四十四条：“无民事行为能力人实施的民事法律行为无效。”
2.违反法律、行政法规的强制性规定，违背公序良俗签署的合同无效
《民法典》第一百五十三条：“违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。
违背公序良俗的民事法律行为无效。”
3.恶意串通签署的合同无效
《民法典》第一百五十四条：“行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益的民事法律行为无效。”
找法网提醒您，合同生效要件为：
1.签订合同的主体适格；
2.双方当事人意思表示是真实的；
3.合同没有违反法律规定或公序良俗。
根据《民法典》第一百四十三条规定，具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
合同的签订生效不可以反悔。依法成立并生效的合同，受法律保护。当事人应当按照约定全面履行自己的义务，不履行合同义务或者履行不符合约定的，应当承担违约责任。
《中华人民共和国民法典》第四百六十五条
依法成立的合同，受法律保护。
依法成立的合同，仅对当事人具有法律约束力，但是法律另有规定的除外。
