企业所得税扣缴方式有查帐征收方式征收企业所得税和核定征收方式征收企业所得税两种。企业所得税扣缴时间是在年度终了后五个月内汇算清缴，按季度或者是按月度进行预缴。
企业所得税扣缴方式:
1.查帐征收方式征收企业所得税。适用于健全帐簿，规范财务核算，正确计算盈亏，依法办理纳税申报，达到查帐征收方式的企业标准的。其计算公式是：应纳税所得额=利润总额+纳税调整增加额-纳税调整减少额-以前年度亏损-免税所得.
2.核定征收方式征收企业所得税。
(1)定额征收，是指税务机关按照一定的标准、程序和办法，直接核定纳税人年度应纳企业所得税额，由纳税人按规定进行申报缴纳的办法。
(2)核定应税所得率征收，是指税务机关按照一定的标准、程序和方法，预先核定纳税人的应税所得率，由纳税人根据纳税年度内的收入总额或成本费用等项目的实际发生额，按预先核定的应税所得率计算缴纳企业所得税的办法。实行核定应税所得率征收办法的，应纳所得税额的计算公式如下：应纳所得税额=应纳税所得额*适用税率应纳税所得额=收入总额*应税所得率或=成本费用支出额/（1-应税所得率）*应税所得率。
企业所得税扣缴时间：可以按季度也可以按月度进行预缴，在年度终了后五个月内汇算清缴，结清应补应退税款。
法律依据：
《中华人民共和国企业所得税法》第五十四条企业所得税分月或者分季预缴。
企业应当自月份或者季度终了之日起十五日内，向税务机关报送预缴企业所得税纳税申报表，预缴税款。
企业应当自年度终了之日起五个月内，向税务机关报送年度企业所得税纳税申报表，并汇算清缴，结清应缴应退税款。
企业在报送企业所得税纳税申报表时，应当按照规定附送财务会计报告和其他有关资料。
企业所得税是对企业的各项收入所得征收的税。企业的应纳税所得额是用企业当年的收入总额，减去不征税收入、免税收入、各项扣除、以及弥补以前亏损的金额。找法网提示您，企业所得税的税率一般是25%。
