根据《中华人民共和国民法典》的规定，仓单可以作为权利凭证进行质押，以仓单质押的，应当在合同约定的期限内将权利凭证将给质权人，质押合同自凭证交付之日起生效。因此，仓单质押作为担保贷款的一种类型是有法律依据的。
根据《中华人民共和国经济合同法》的规定，只要银行和企业双方共同协商签订抵押贷款合同时，具体载明有关仓单质押方面的条款，并明确相互的责任和任务，此合同已经签订，就具有法律约束力。
从上述操作程序中可以看出，仓库和银行、货主企业之间都存在着委托代理关系，一种是作为银行的代理人，监管货主企业在仓库中存储货物的种类、品种和数量等;另一种是作为货主企业的代理人管理仓库中货主企业的货物，包括管理货物的进出库，确保仓储货物的安全、防潮、防霉等。正是由于存在这种三方的代理关系，仓储企业实施仓单质押业务有许多潜在风险。
（一）客户（货主企业）资信风险。在选择客户时一定要谨慎，要重点考察企业的经营能力和信用状况，反映企业经营状况是否正常的最直接指标是主营业务的增长率，因此选择客户的主营业务增长率要大于零，最好大于该行业的平均增长率。
（二）质押商品的种类要有一定的限制。要选择适用广泛，易于处置，价格涨跌幅度不大，质量稳定的品种，如黑色金属、有色金属、大豆等，同时还要考察货物来源的合法性，对于走私货物和违禁物品要及时举报。
（三）要加强对仓单的管理。虽然我国合同法中规定了仓单上必须记载的内容:存货人的名称或者姓名和住所、仓储物的品种、数量、质量、包装、件数和标记、仓储物的损耗标准、储存场所、储存期间、仓储费、仓储货物保险情况、填发人、填发地点和填发时间。但目前我国使用的仓单还是由各家仓库自己设计的，形式很不统一，因此要对仓单进行科学的管理，使用固定的格式，按制定方式印刷;同时派专人对仓单进行管理，严防操作失误和内部人员作案，保证仓单的真实性、唯一性和有效性。
（四）要加强对质押货物的监督管理。仓储企业在开展仓单质押业务时，一般要与银行签订 t;不可撤销的协助行使质押权保证书 ，对质押货物的保管负责，丢失或损坏由仓库承担责任。因此，为了维护自身利益和履行对银行的承诺，仓储企业要加强对质押货物的监管，保证仓单与货物货单一致，手续完备，货物完好无损。
（五）要注意提单风险。对于同一仓单项下的货物在不同时间提取的情况，要依据货主和银行共同签署的 ;专用仓单分提单 释放，同时按照仓单编号、日期、金额等要素登记明细台帐，每释放一笔，就要在相应仓单下作销账纪录，直至销售完成为止。
由于仓单质押业务涉及到仓储企业、货主和银行三方的利益，因此要有一套严谨、完善的操作程序。
首先货主（借款人）与银行签订《银企合作协议》、《帐户监管协议》；仓储企业、货主和银行签订《仓储协议》；同时仓储企业与银行签订《不可撤销的协助行使质押权保证书》。
货主按照约定数量送货到指定的仓库，仓储企业接到通知后，经验货确认后开立专用仓单；货主当场对专用仓单作质押背书，由仓库签章后，货主交付银行提出仓单质押贷款申请。
银行审核后，签署贷款合同和仓单质押合同，按照仓单价值的一定比例放款至货主在银行开立的监管帐户。
贷款期内实现正常销售时，货款全额划入监管帐户，银行按约定根据到帐金额开具分提单给货主，仓库按约定要求核实后发货；贷款到期归还后，余款可由货主（借款人）自行支配。
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