合同补充协议规定在《民法典》第五百一十条中有体现，合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。
合同补充协议的生效条件如下：
1.不违反法律的禁止性和限制性规定，且充分尊重当事人双方的意思自治；
2.主合同成立且有效。
找法网提醒，合同的补充是以合同的成立和有效为前提的，如果欠缺合同成立的必备条件和必要条款，或者合同被确认无效或者被撤销，自然就没有合同补充的必要了。另外，对合同进行补充的方法应该按照顺序进行，首先应由当事人进行协议补充，在当事人不能达成补充协议，即当事人不愿协商或者当事人经协商但未达成一致的情况下，才应按照合同有关条款或者交易习惯确定。按后一种方法对合同予以补充的主体是人民法院或者仲裁机构，而不是合同当事人。
补充协议是对原合同的补充或者变更，一般要明确约定，如果补充协议条款与原合同不一致或发生冲突时，应当与补充协议为准，但原合同明示不得变更的条款，补充协议中对该条款发生的变更则不发生法律效力。
当补充合同的约定与主合同的约定发生矛盾时，应该以时间在后的约定条款为准执行。所以，补充合同的效力优于主合同的效力。
时间在后的约定，实际上是对主合同的原约定的重新修订，该新约定是补充合同的精要和实质。
如果仍以主合同的原条款为准执行，那就失去了补充合同存在的意义。
