工程欠款在工程验收合格后可以起诉。工程欠款的诉讼时效是三年，《民法典》第一百八十八条规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
工程欠款违约金的计算在法律上没有统一的标准，应当由双方协商来进行认定，并签订合同来具备效力。违约金是指按照当事人的约定或者法律直接规定，一方当事人违约的，应向另一方支付的金钱。找法网提醒您，违约金的标准是金钱，但当事人也可以约定违约金的标的物为金钱以外的其他财产。
建筑工程欠款合同纠纷的解决方法：
1.双方协商解决；
2.通过民间调解组织解决；
3.通过诉讼解决，但诉讼中应注意以下几点：
(1)将发包人或非法分包人、转包人、附属人列为被告或第三人，并在一起案件中处理；
(2)区分质量或工期延误的原因，依法确定责任方，然后依法主张权利；
(3)注意增项款应与进度款同时支付；
(4)必须注意证据的收集，保留施工方撤离不是原因造成的证据，保留已完成数量的证据；
(5)尽量采取财产保全措施或者主张优先受偿权，在特定情况下可以主张先付。
