法律分析：公司申请破产，但是没有钱赔偿员工时，员工可以向人民法院提起诉讼，但是不能申请劳动仲裁。公司进行破产清算的，应当支付劳动者一定金额的经济补偿金，具体数额按照劳动者在该单位工作的期限来计算。
主张经济补偿金的劳动者可以直接向破产的管理人提出，由管理人列出清单，经过公示后就可以领取补偿金。劳动者对公司发放补偿金的清单存在异议的，可以要求管理人员予以更正。
同时如果这时候，公司的管理人声称公司已经没有钱的，劳动者应当及时向受理破产申请的人民法院提起诉讼。由于企业在进入清算程序后，不能够再适用其他诉讼或者仲裁的程序，一切纠纷只能在受理破产的法院进行。
因此，劳动者不能提起劳动争议仲裁，只能向受理破产申请的人民法院提起诉讼。法律依据：《中华人民
共和国劳动合同法》第四十一条 有下列情形之一，需要裁减人员二十人以上或者裁减不足二十人但占企业职工总数百分之十以上的，用人单位提前三十日向工会或者全体职工说明情况，听取工会或者职工的意见后，裁减人员方案经向劳动行政部门报告，可以裁减人员：
（一）依照企业破产法规定进行重整的；
（二）生产经营发生严重困难的；
（三）企业转产、重大技术革新或者经营方式调整，经变更劳动合同后，仍需裁减人员的；
（四）其他因劳动合同订立时所依据的客观经济情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行的。裁减人员时，应当优先留用下列人员：
（一）与本单位订立较长期限的固定期限劳动合同的；
（二）与本单位订立无固定期限劳动合同的；
（三）家庭无其他就业人员，有需要扶养的老人或者未成年人的。用人单位依照本条第一款规定裁减人员，在六个月内重新招用人员的，应当通知被裁减的人员，并在同等条件下优先招用被裁减的人员。
《中华人民共和国公司法》第一百八十七条 清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，发现公司财产不足清偿债务的，应当依法向人民法院申请宣告破产。公司经人民法院裁定宣告破产后，清算组应当将清算事务移交给人民法院。
《中华人民共和国企业破产法》第一百一十三条 破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：
（一）破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金；
（二）破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款；
（三）普通破产债权。破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按照比例分配。破产企业的董事、监事和高级管理人员的工资按照该企业职工的平均工资计算。
