合同效力纠纷的处理方式如下：
1.协商解决。双方当事人在平等自愿的基础上，通过友好协商、互谅互让达成和解协议，进而解决纠纷。
2.调解解决。在有关组织(如人民调解委员会)或中间人的主持下，在平等、自愿、合法的基础上分清是非、明确责任，并通过摆事实、讲道理，促使双方当事人自主达成协议，从而解决纠纷。
3.诉讼解决。找法网提醒您，通过打官司解决，它指纠纷当事人一方依法向人民法院起诉，由法院依法审理，作出判决或裁定，通过当事人对生效裁判的自觉履行或人民法院的强制执行而解决纠纷。
无效和被撤销的合同自始至终无效，生效的合同出现可撤销情形时才能撤销，所以确认合同无效和撤销不能同时主张。《中华人民共和国民法典》第一百五十五条【无效、被撤销的民事法律行为自始无效】无效的或者被撤销的民事法律行为自始没有法律约束力。
第一百五十七条【民事法律行为无效、被撤销或确定不发生效力的法律后果】民事法律行为无效、被撤销或者确定不发生效力后，行为人因该行为取得的财产，应当予以返还;不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方由此所受到的损失;各方都有过错的，应当各自承担相应的责任。法律另有规定的，依照其规定。
确认合同效力纠纷有诉讼时效，确认合同效力的诉讼不属于相关法律规定不适用诉讼时效的情形，所以确认合同的效力是有诉讼时效期限限制的。确认合同的效力是有诉讼时效限制的，根据《民法典》规定，诉讼时效是三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害之日起开始计算。
