（一）适用对象不同：诉讼时效适用于请求权；除斥期间适用于形成权。
（二）法律效力不同：诉讼时效的法律效力表现为胜诉权之丧失，权利本身并不消灭；除斥期间的法律效力表现为形成权的消灭。
（三）价值取向不同：设置诉讼时效的价值在于促使权利人及时行使权利，加速财产的流转，消灭原有法律关系；设置除斥期间的价值在于消除当事人关系中的不确定、不稳定因素，维护交易安全，维护原有法律关系。
（四）期间和计算不同：诉讼时效一般长于除斥期间，而且诉讼时效可能中止、中断甚至延长；而除斥期间固定不变。
（五）适用的主动性不同：法官不能迳行适用诉讼时效，只在义务人主张时效利益时，法官才能适用；但是法官可以依职权主动适用除斥期间。
民法典规定，一般的诉讼时效为三年，从权利人知道或应当知道权利受到损害之日起开始计算，但有以下特殊的情形不适用诉讼时效：
《中华人民共和国民法典》第一百九十六条规定，下列请求权不适用诉讼时效的规定：
（一）请求停止侵害、排除妨碍、消除危险；
（二）不动产物权和登记的动产物权的权利人请求返还财产；
（三）请求支付抚养费、赡养费或者扶养费；
（四）依法不适用诉讼时效的其他请求权。
诉讼时效的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。
但是自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护；有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
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