1、多式联运经营人可以与参加多式联运的各区承运人约定相互之间的责任，但该约定不影响多式联运经营人对全程运输承担的义务。也就是说，多式联运经营人对全程运输中所发生的责任对托运人或者收货人负全责，但是多式联运经营人可以参加多式联运的各区段运输承运人约定相互之间的责任。
2、在多式联运中，实行统一责任制度，即多式联运经营人对全程运输负责，多式联运经营人与实际承运人之间可另以合同约定相互之间的责任。例如在一个海陆空的多式联运合同中，多式联运经营人可以与海上运输区段的承运人、陆路运输区段的承运人、航空运输区段的承运人分别对每一段的运输责任进行约定，在多式联运经营人对托运人或者收货人负全程的运输责任后，可以依据其与每一区段的运输承运人签订的合同，向其他承运人追偿。
根据多式联运合同的性质，其必然涉及种类不同的有关运输的法律法规。多式联运经营人赔偿责任和责任限额的确定应当分下列三种不同情况处理：
1、如果货物发生毁损灭失的区段是确定的，多式联运经营人的赔偿责任和责任限额，适用调整该区段运输方式的有关法律的规定，例如托运人与多式联运经营人签订了一项从北京至纽约的多式联运合同，全程运输分为三个区段，首先是从北京至天津的公路运输，其次是天津到旧金山的国际海运，最后是从;旧金山到纽约的铁路运输，如果货物的毁损、灭失能够确定发生在中国的公路运输区段，则多式联运经营人的赔偿责任和责任限额就按中国的公路运输方面的法律或者行政法规进行确定;如果发生在国际海运区段则按《中华人民共和国海商法》的有关规定进行赔偿;如果发生在美国的铁路运输区段，就应按照美国的铁路法的规定进行办理。
2、货物发生毁损、灭失的运输区段不能确定的，多式联运经营人应当依照有关规定承担损害赔偿责任。在多式联运中，货损发生的运输区段有时不易查清，对这一类货损采用某项统一规定的办法确定经营人的责任，在我国根据关于承运人赔偿责任和责任限额的规定负赔偿责任。
3、在货损区段能够确定时，多式联运经营人可以向其他承运人追偿;如果货损的区段不能确定的，除合同另有约定外，多式联运经营人是无法向任何人追偿的。多式联运经营人要摆脱这种损失，唯一的办法就是通过与参加多式联运的各区段承运人订立的运输合同取得适当解决。
托运人与承运人签订货物运输合同并将托运货物提交给承运人起，至承运人将货物交付给收货人时止，托运货物处于承运人的实际控制之下，对于此期间所发生的货物毁损、灭失，承运人应当承担损害赔偿责任。承运人对托运货物毁损、灭失和责任承担，包括以下两个方面：
1、货物发生了毁损。所谓毁损，是指托运人按照货物运输合同的约定交给承运人托运人货物，在运达目的地时，已经受到了损坏，造成了货物价值的减少。
2、货物已经灭失。所谓灭失，是指托运人按照货物运输合同的约定交给承运人托运的货物，在到达目的地时，承运人已经无法将托运货物交付给收货人。货物灭失又包括两种情况：一是货物在物质意义上的灭失，如玻璃制品被打碎;二是货物在法律意义上的灭失，如货物已经被盗走，在此种情况下，货物本身还存在，但承运人已经无法交付给收货人。
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