做工程遇到了纠纷的处理方式如下：
1.协商
合同当事人在友好的基础上，通过相互协商解决纠纷，这是最佳的方式。
2.调解
合同当事人如果不能协商一致，可以要求有关机构调解。
3.仲裁
合同当事人协商不成，不愿调解的，可根据合同中规定的仲裁条款或双方在纠纷发生后达成的仲裁协议向仲裁机构申请仲裁。
4.诉讼
如果合同中没有订立仲裁条款，事后也没有达成仲裁协议，找法网提醒您，合同当事人可以将合同纠纷起诉到法院，寻求司法解决。
建设工程纠纷的主要种类如下：
1.建设工程民事纠纷
发包人和承包人就有关工期、质量、造价等产生的建设工程合同争议，是建设工程领域最常见的民事纠纷。
2.建设工程行政纠纷
行政行为是执行法律的行为。任何行政行为均须有法律根据，具有从属法律性，没有法律的明确规定或授权，行政主体不得作出任何行政行为。
工程纠纷诉讼时效是三年，自纠纷产生之日起计算。法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
《中华人民共和国民法典》第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
