按照我国《民事诉讼法》及最高院司法解释的规定，合同纠纷，由被告住所地或合同履行地人民法院管辖。如果合同没有实际履行，当事人双方住所地又都不在合同约定的履行地的，应由被告住所地人民法院管辖。同时，法律赋予当事人协议约定管辖法院的权利，即合同的双方当事人可以在书面合同中协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地人民法院管辖，但不得违反民诉法对级别管辖和专属管辖的规定。在股权转让协议纠纷中，如果双方当事人对管辖法院有约定且约定有效的，应适用其约定；没有约定或约定不明，应适用法律规定，即由被告住所地或合同履行地人民法院管辖。对于被告所在地，人们一般不会有歧义。而对于股权转让的合同履行地，应为股权转让的目标公司的公司注册地。因为，公司股权转让纠纷的特殊性在于转让行为需要向公司注册地的登记机关履行相应手续方可完成（如果是外资企业，在工商变更之前还需要商务主管部门的批复，否则股权转让合同不生效）。
股权与债权的区别如下：
1.股权与债权的权利类型不同。
股权属于物权的范畴，债权则不属于物权的范畴。物权是权利人直接支配其标的物并享受其利益的权利，具有排他性。股权的内容主要为股东共同行使对公司财产的支配权和收益权，并排除股东以外的他人的干涉。因此，股权具有物权的特征，属于物权的范畴。债权以债权人请求债务人履行特定的债务为主要内容，债权的客体虽然一般表现为财物，但债权并不属于物权的范畴。债权是物权之外的独立的权利类型。
2.股权与债权的发生根据不完全相同。
股权的发生根据一般为投资行为或者交易行为，原始股股东的股权的发生根据是股东对公司的直接投资行为，非原始股股东的股权的发生根据是股东之间以股票买卖为表现的对公司的投资转让行为。债权的发生根据有多种，常见的是以合同为基础的买卖行为，买卖的标的一般为财物，此种情况下的股权与债权的发生根据可以相同。债权的发生根据也可以是侵权行为等，因侵权行为发生的债以及债权和债务，其发生的根据就不同于股权的发生根据。因此，股权与债权的发生根据不完全相同。
3.股权与债权的权利内容不完全相同。
股权的权利内容主要为所有者的资产受益、重大决策和选择经营者等权利。股权中的资产受益、对公司资产的处分权等是具有所有权性质的权利，股权中的重大决策和选择经营者等权利则是具有经营权性质的权利。债权的内容通常有给付请求权、给付受领权、保护请求权、处分权。以给付一定财产为内容的债权，直接表现为财产性的权利内容。以请求保护为内容的债权，并不一定表现为具有财产性的权利内容。权利人对公司享有的债权，其权利内容就是要求公司在公司债券到期后偿付本金和利息。权利人对公司的债权是一种给付请求权，以财产为内容，但又不同于股权中的财产内容。股权与债权的权利内容有相同的一方面，也有不相同的一方面。
4.股权与债权的行使方式不同。
股权具有物权的性质，更具有所有权的性质。物权是一种绝对权，其行使不涉及其他特定主体的作为或者不作为。股权的主体是股东，股东行使股权方式一般为股东直接通过股东大会的方式进行，或者通过委托授权的方式进行，股权的行使不需要依赖特定主体履行相应的义务。经常出现的中小股东的股权难以体现甚至遭受侵犯的现象，并不是因为股权的行使需要特定义务人的配合，而是因为大股东对中小股东的欺压，或者是因为公司管理人对中小股东合法权益的侵犯。债权的行使需要特定债务人的配合，没有债务人的一定行为，债权人无法实现其债权。债权以特定主体之间的法律关系的存在为前提，债权是一种请求权，这是其基本特征，这也表明债权的实现方式不同于物权。
5.股权与债权的限制不同。
每个股东的股权行使要受到公司章程的约束，即受到股东之间的相互约束。这种约束是以股东自愿为基础的，是为了股东的共同利益而设定的。股东的股权受到的约束，表面上看似乎是受到了公司及公司管理层的约束，实际上这种约束最终仍然是来自股东自身的，更多是来自大股东对小股东的限制。债权人对债权的行使与实现，要依赖于债务人的一定行为，要受到债务人的限制。另外，对于以给付一定财物为内容的债权，又受到一定期限的限制，在债权债务未到期之前，债权人不能行使其债权；而在诉讼上，债权到期后，债权人如果不在法定期限内行使其债权，就可能会丧失其债权。股权与债权各自具有的特殊性，表明股权与债权是不同性质、不同类型的两种权利。投资者对公司的股权与债权人对公司的债权，存在着多种具体的差别，决定了这两种权利各有其利弊。股权转债权，在认识上要解决的问题，就是认清股权与债权的差别与利弊，找出消除差别与平衡利弊的合理方案。
《中华人民共和国民法典》第四百四十三条规定，以基金份额、股权出质的，质权自办理出质登记时设立。
基金份额、股权出质后，不得转让，但是出质人与质权人协商同意的除外。出质人转让基金份额、股权所得的价款，应当向质权人提前清偿债务或者提存。
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