国土资源行政主管部门发现土地登记簿记载的事项确有错误的，根据错、漏登记宗地的原土地所有者或使用者的原土地登记申请书，进行补充地籍调查，填写土地变更登记审批表，报原批准登记发证机关审批，更改或更换土地登记卡、簿，同时书面通知原土地证书持有人在规定期限内到国土资源行政主管部门办理更换或注销原土地证书手续。当事人逾期不办理的，国土资源行政主管部门报经人民政府批准并公告后，原土地权利证书废止。
2、重复征用或划拨，以后者为准。
3、界线与面积不吻合的，以界线为准。
土地权属确认的基本方法是调查、申报登记、核发证书，因此，确权主要是通过权属调查和申请土地登记、核发证书实现的。
第二步：入户权属调查。根据基础工作底图和农户承包地登记基本信息表，入户实地进行承包地块权属调查，由农户进行确认。对存在争议的地块，待争议解决后再登记。
第三步：测量地块成图。按照农村承包土地调查技术规范对承包地块进行测量和绘图，并标注地块编码和面积，形成承包土地地籍草图。
第四步：公示审核。由村、组土地承包经营权确权登记工作组审核地籍草图后，在村、组公示。有异议的，及时进行核实、修正，并再次公示；无异议的，由农户签字确认后作为承包土地地籍图，由村组上报乡（镇）人民政府。乡（镇）人民政府汇总并核对后上报县（市、区）人民政府。
第五步：建立登记簿。根据乡镇上报的登记资料，由县（市、区）农村土地承包管理部门按照统一格式建立土地承包经营权登记簿。土地承包经营权登记簿应当采用纸质和电子介质，并进行异地备份。
第六步：完善承包经营权证书。各地根据实际，依照土地承包经营权登记簿记载内容，适时对承包经营权证书进行完善。
第七步：建立农村土地承包管理信息系统。县（市、区）农村土地承包管理部门应当根据登记过程中形成的影像、图表和文字等材料，按照统一的标准建立农村土地承包信息数据库和农村土地承包管理信息系统，实现农村土地承包管理信息化。
第八步：资料归档。按照档案管理相关规定，将农村土地承包经营权确权登记资料整理归档保存。
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