土地承包经营权流转手续的办理是：
1、土地承包经营权采取转包、出租、互换、转让或者其他方式流转，当事人双方应当签订书面合同；
2、采取转让方式流转的，应当经发包方同意；采取转包、出租、互换或者其他方式流转的，应当报发包方备案；
3、当事人要求登记的，应当向上级农业承包合同管理部门申请登记。
根据《农村土地承包法》第七条，农村土地承包应当坚持公开、公平、公正的原则，正确处理国家、集体、个人三者的利益关系。
1、土地转包，即承包方将自己承包期内承包的部分或全部土地承包经营权以一定期限转给同一集体经济组织的其他农户从事农业生产经营。
2、土地转让，即承包方将其拥有的未到期的土地承包经营权以一定的方式和条件转移给他人。
3、土地出租，即承包方作为出租方，将自己承包期内部分或全部土地承包经营权以一定期限租赁给他人从事农业生产经营，并收取租金。
4、土地互换，即土地承包经营权人将自己的土地承包经营权交换给他人行使，自己行使从他人处换来的土地承包经营权。
5、土地入股，即在承包期内，承包方将土地承包经营权量化为股份，以股份入股形式与他人共同生产，按股分红。
6、反租倒包，即由农村集体经济组织出面把农户的承包地反租过来，集中连成一片，给予农户适当的经济补偿，再把土地承包进行转租或发包给农户、个人或企业单位。
7、土地托管，即承包方承包地委托农业服务组织或农户代为经营管理，托管双方签订协议，委托方向受托方支付一定的费用。
1、农民利益问题。一是不能违背农民的意愿强迫流转，流转的条件、方式、价格等应由农户自主决定;二是土地流转后农户的既得利益要不低于或高于土地流转前，否则流转将很难实行。
2、流转主体问题。一是采取转包及互换方式的，不得向本集体经济组织以外的农户进行流转;二是采取转让方式流转的， 可以向集体经济组织以外的农户、单位和个人流转，但由于这种流转方式使得流转方在承包期内失去了土地承包经营权，应当坚持“稳妥、慎重、本集体经济组织成员优先”的原则。
3、流转年限问题。除“四荒地”(荒山、荒沟、荒丘、荒滩)外，农民的土地承包经营权流转合同签订的时间不宜过长， 到期后，根据实际情况再进行续签。
4、流转土地的用途问题。必须严格遵守《农村土地承包法》 和《农村土地承包经营流转管理办法》的有关规定，不得以调整产业结构、发展农村经济等理由擅自改变原有耕地的农业用途。
5、流转合同签订问题。流转合同必须使用政府统一制订的合同文本。签订合同时应当由承包方或其书面委托的代理人签订; 流转合同中要注明流转土地的边界、坐落、面积、质量等级和流转土地的用途等内容。
6、流转土地的界限问题。乡(镇)农经部门要在流转土地丈量划分上严格把关，明确土地界址，确保流转土地面积与流转合同面积相符，不留隐患。
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