土地承包经营权纠纷是指当事人间因承包土地的使用、收益、流转、调整、收回以及承包合同的履行等事项发生的争议。它既可能发生在承包土地的农民之间，也可能发生在承包土地的农民与农村集体经济组织或者自治组织之间，还可能发生在农民和其他单位或者个人之间。
因土地承包经营发生纠纷的，双方当事人可以通过协商解决，也可以请求村民委员会、乡(镇)人民政府等调节解决。当事人不愿协商、调解或者协商、调解不成的，可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，也可以直接向人民法院起诉。
对行政机关依据职权侵犯农村土地承包经营权的，还可以申请行政复议，对行政复议结果不服的，除法律规定的少数事项外，还可以向人民法院提起诉讼。
协商解决是指当事人再发生土地承包经营权纠纷后，在自愿互谅的基础上，直接进行磋商谈判，自行解决争议。调解是指在当事人自愿的基础上，由当事人双方同意的第三者从中进行沟通、斡旋，使纠纷当事人自行达成解决纠纷的办法。
民法典对农村土地承包合同纠纷如何处理没有作出规定，土地承包纠纷可以通过协商、调解、诉讼等方式解决。
第三百三十条 【双层经营体制与土地承包经营制度】农村集体经济组织实行家庭承包经营为基础、统分结合的双层经营体制。
农民集体所有和国家所有由农民集体使用的耕地、林地、草地以及其他用于农业的土地，依法实行土地承包经营制度。
第三百三十二条 【土地承包期】耕地的承包期为三十年。草地的承包期为三十年至五十年。林地的承包期为三十年至七十年。
前款规定的承包期限届满，由土地承包经营权人依照农村土地承包的法律规定继续承包。
（一）土地承包经营权侵权引发的纠纷。
1、在原地取得承包地后婚嫁到新地，原地收回其承包地引发纠纷;
2、死亡后，土地承包经营权是否随承包地存在，引发纠纷;
3、取得承包地后，因升学、当兵提干、当工人当公务员、有固定工作，户口也迁出(离乡该离土但未离土)，土地承包经营权是否随承包地存在引发纠纷;
4、自动放弃承包地，进城经商务工办企业，但户口仍在原地(离土未离乡)，土地承包经营权引发纠纷。
5、外出打工将土地转包给他人引发的纠纷。
（二）土地流转不规范导致的纠纷。由于国家“三农”优惠政策的出台，农村土地越来越俏。因以前农村土地流转手续不完备、不配套，土地流转行为不规范而引发的土地承包纠纷频频发生。一是转包转让型纠纷。如税改前，种田效益不高，一些农户将土地转让给他人承包，其税费也相应地由接受者承担。现在不仅土地税费减免，而且种粮还可以拿到“两补”，原承包户纷纷要求被转让户退还其承包地，被转让户又不愿退，于是双方发生纠纷。二是代耕代种型纠纷。一些农民承包集体土地后，没有耕种土地，而是转让给他人种植，后来原土地承包人欲收回土地经营权，与种植人发生纠纷。
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